由于实验室清洗机的超声波的能量能够穿透玻璃器皿的内壁和细微的缝隙、小孔、死角，配备不同的车架可以清洗玻璃器皿、试管、烧杯、载玻片、盖玻片、玻璃吸管、培养皿、三角烧瓶、移液管和其他实验室器皿清洗。
当被清洗件为精密玻璃器皿、部件或装配件时，实验室清洗机往往成为能满足其特殊技术要求的的清洗方式。
实验室清洗机清洗操作工艺流程如下：
1、在清洗槽内加入自来水，水位保证高于或等于清洗池内槽高度的3/4，启动电加热，同时启动超声波进行脱气，水温40度左右时加入规定量的超声波清洗剂，待水温达到55~60度时开始清洗零部件。
2、将所需清洗的零部件尽量解体，利用高压水枪、钢丝刷、铲刀或其它工具将其零件表面的泥土、重油污及重积炭进行人工辅助预处理，以保证清洗液的使用寿命及清洗速度和效果。
3、将所需清洗的零部件放入清洗池中，摆放不重叠，保证零件*被清洗液淹没。
4、启动超声波，一般定时清洗40~60分钟，清洗完毕后关闭超声波，取出零部件进行后处理。
5、利用高压水枪将零部件表面的残留物去除，利用空气压缩枪将孔道内的残留物去除。需要防锈的部件另行处理。为提高清洗效果，可在时间允许的情况下，
可适当延长零部件在清洗液中的清洗时间。在实际操作过程中，为提高清洗效率，可以采取随拆解、随清洗的工艺流程。
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